Short Description
Zentrale Datenbank zur Erfassung von digitalisierten mikroskopischen Präparaten der österreichischen Pathologie-Institute. Die Datenbank beinhaltet Metadaten und Verknüpfungen zu den lokal gespeicherten Whole Slide Imaging (WSI) Daten, sowie Angaben zur Governance der Daten. WSI selbst werden hier nicht gespeichert. Die Datenbank dient zur Bildung von Studienkohorten für die KI / AI Forschung und Entwicklung, sowie Validierung von KI Software auf dem Gebiet der Pathologie. Aktuell beteiligt sind die Med Uni Graz, Med Uni Innsbruck, JKU Linz, Vet Med Wien und Med Uni WIen. Prinzipiell ist die Datenbank offen für Kooperationen mit anderen Pathologie-Instituten.
Diese Datenbank ist Teil des Projektes "Digitale Pathologie – Schaffung einer interuniversitären kompatiblen Infrastruktur"
Das vorliegende Projekt hat die Ziele:
a) Schnittpräparate als digitale mikroskopische Bilddaten in sehr großem Umfang kontinuierlich zu erstellen und zu speichern.
b) Erhebung von standardisierten Metadaten und Zusammenführung in einem standortübergreifenden, anonymisierten Datenkatalog, der in die Europäische Forschungsinfrastruktur (EOSC) angebunden sein wird.
Diese Bilddaten, verknüpft mit Metadaten, werden für Forschungsprojekte für künstliche Intelligenz in einer interuniversitären kompatiblen Infrastruktur zur Verfügung stehen.
Contact Person
Dipl. Ing. Dr. Markus Plass
Research Services
Die Datenbank steht derzeit nur den teilnehmenden Forschungsinstituten zur Verfügung.
Kontakt: markus.plass@medunigraz.at und peter.regitnig@medunigraz.at
Methods & Expertise for Research Infrastructure
Die Datenbank dient der Erfassung von Metadaten und Speicherorten der Whole Slide Images aus der Digitalen Pathologie verschiedenster Institutionen in Österreich.
Equipment
Eine Kooperation ist zu vereinbaren. Bitte richten Sie sich bei Interesse an den Projektleiter.
Institut für Pathologie der Medizinischen Universität Innsbruck
Pathologie und Molekularpathologie des Kepler Universitäts Klinikums
Institut für Pathologie, Veterinärmedizinische Universität Wien
Klinisches Institut für Pathologie, der Medizinischen Universität Wien
Institute of Computer Graphics and Vision, Technische Universität Graz