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Core Facility (CF)

BOKU Core Facility Biomolecular & Cellular Analysis (BMCA)

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Universität für Bodenkultur Wien (BOKU)

Wien | Website

Open for Collaboration

Kurzbeschreibung

Die BOKU Core Facility Biomolecular & Cellular Analysis (BMCA) ist ein hochmodernes analytisches Labor, das Zugang zu modernen Analysegeräten und fachlicher Expertise bietet und sich auf drei zentrale Bereiche spezialisiert: biomolekulare Analysen, einschließlich der Charakterisierung von Proteinen und Partikeln sowie der Untersuchung biomolekularer Wechselwirkungen; zelluläre Analysen mittels Durchflusszytometrie, einschließlich Zellanalyse und -sortierung; sowie Strukturanalyse mittels Röntgenkristallographie und BioSAXS, unterstützt durch eine umfassende Infrastruktur für Probenvorbereitung, Datenerhebung und Datenverarbeitung.

Ansprechperson

Irene Schaffner, PhD; Elisabeth Laurent, PhD

Research Services

Über den Zugang zu moderner Forschungsinfrastruktur hinaus begleiten wir Forschende entlang des gesamten experimentellen Prozesses – von der optimierten Probenvorbereitung bis hin zur Datengenerierung. Im Rahmen unseres Trained-User-Modus bieten wir praxisorientierte Einschulungen in spezialisierte Methoden sowie fachkundige Beratung bei der Versuchsplanung und dem experimentellen Design. Für Forschende, die eine umfassende Betreuung wünschen, umfasst unser Full-Service-Modus die Durchführung von Messungen durch erfahrenes Fachpersonal sowie die Erstellung detaillierter Versuchsberichte, um zuverlässige und qualitativ hochwertige Ergebnisse sicherzustellen.

Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur

--Biomolekulare Analyse--

• Proteinreinigung – ÄKTA go Flüssigchromatographiesystem (Cytiva)
Präparative Aufreinigung von Proteinen im Labormaßstab, finaler Aufreinigungsschritt für Proteinproben

• Molekulargewicht & Probenqualität – OMNISEC System (Malvern Panalytical)
Bestimmung von Molekulargewicht, Konzentration, oligomerem Zustand und Probenreinheit mittels SEC mit LS-, UV- und RI-Detektion

• Partikelgrößenanalyse – Zetasizer Nano ZSP (Malvern Panalytical)
Bestimmung von Partikelgröße und Zeta-Potential, Analyse von Stabilität und Aggregationsverhalten

• Konzentration & Partikelgröße – Stunner (Unchained Labs)
Bestimmung von Konzentration, Partikelgröße und Aggregation mittels UV/Vis und DLS

• Thermische & kolloidale Stabilität – Uncle (Unchained Labs)
Analyse von Proteinentfaltung, Aggregation, Partikelgröße und Stabilität in einem Experiment

• Thermische Stabilität – PEAQ-DSC Automated (Malvern Panalytical)
Bestimmung von Entfaltungstemperatur und thermodynamischer Stabilität von Biomolekülen

• Biomolekulare Interaktionen in Lösung – PEAQ-ITC Automated (Malvern Panalytical)
Bestimmung von Bindungsaffinität, Stöchiometrie sowie Enthalpie und Entropie biomolekularer Interaktionen

• Biomolekulare Interaktionen & Kinetik – Octet R8e (Sartorius)
Bestimmung von Bindungskinetiken und Affinitäten mittels Bio-Layer Interferometry (BLI)

• Biomolekulare Interaktionen & Kinetik – Biacore T200 (Cytiva)
Hochsensitive Analyse von Bindungskinetiken und Affinitäten mittels Surface Plasmon Resonance (SPR)


--Zelluläre Analyse--

• Zellanalyse – CytoFLEX S (Beckman Coulter)
Multiparametrische Zellanalyse mit 4 Lasern und bis zu 13 Fluoreszenzkanälen, Detektion von Nanopartikeln ab 80 nm und Bestimmung absoluter Zellzahlen

• Zellsortierung (FACS) – Sony SH800
Automatisierte Analyse und hochreine Sortierung von Hefe-, Bakterien-, Pflanzen- und Säugerzellen, inklusive Einzelzell-, Pool- und Index-Sorting

• Zellsortierung (FACS) – CytoFLEX SRT (Beckman Coulter)
Hochsensitive multiparametrische Analyse und Sortierung von Zellen und Nanopartikeln ab 100 nm, inklusive Einzelzell-, Pool- und Index-Sorting


--Strukturanalyse--

Wir bieten eine umfassende Infrastruktur und Unterstützung für Röntgenkristallographie und BioSAXS und begleiten den gesamten Workflow von der Probenvorbereitung bis zur Strukturanalyse. Unsere Services umfassen:
• Kristallisationsansätze, Optimierung und Kristallhandling (Harvesting, Einfrieren und Lagerung)
• Koordination von Proben- oder Kristallversand sowie Datensammlung an Synchrotron-Beamlines (BioSAXS- und MX-Beamlines)
• Datenprozessierung und Strukturaufklärung

• Präzises Pipettieren (nL) – Mosquito LCP (SPT Labtech)
Automatisiertes Liquid Handling für Protein-Kristallisation, präzise Dosierung von Nanoliter-Volumina bis ca. 25 nL, besonders proteinsparend und geeignet für anspruchsvolle Kristallisationsbedingungen

• Monitoring von Kristallisationsplatten – Rock Imager 1000 (Formulatrix)
Vollautomatisierte Bildgebung und Überwachung von bis zu 250 Kristallisationsplatten mittels sichtbarem Licht, UV und Fluoreszenz, zuverlässige Identifikation von Proteinkristallen

• Probenvisualisierung – SteREO Discovery.V12 (Zeiss)
Stereomikroskop zur dreidimensionalen Beobachtung, Manipulation und Dokumentation von Proteinkristallen bei variabler Vergrößerung

• Erstellung & Optimierung von Kristallisationsbedingungen – Formulator 10 (Formulatrix)
Automatisierte Erstellung von Kristallisationsbedingungen in 96-Well-Platten, präzises Dosieren verschiedener Komponenten mittels mikrofluidischer Technologie

Equipment

  • ZetaView Nano Particle Tracking Analyzer
  • Surface Plasmon Resonance Spectrometer Biacore T200
  • PEAQ Isothermal Titration Calorimeter Automated (Malvern Panalytical)
  • PEAQ Differential Scanning Calorimeter Automated (Malvern Panalytical)
  • Durchflusszytometer CytoFLEX S (4 Laser)
  • Zellsortiersystem SH800 (Sony)
  • Mikroskop SteREO Discovery.V12
  • Vollau­to­ma­ti­sches Kristal­li­sa­ti­ons­plat­ten­moni­toring System Rock Imager 1000
  • Pipettierroboter mosquito® LCP
  • OMNISEC GPC/SEC-Multidetektorsystem
  • ÄKTA go Flüssigchromatographiesystem
  • Octet R8e
  • Zellsortiersystem CytoFLEX SRT
  • Stunner
  • Uncle

Nutzungsbedingungen

Bitte um Kontaktaufnahme per email an bmca@boku.ac.at

Kontakt

Irene Schaffner, PhD; Elisabeth Laurent, PhD
BOKU Core Facility Biomolecular & Cellular Analysis (BMCA)
+43 (1) 47654 -35011, -35012
bmca@boku.ac.at
https://boku.ac.at/cf/bmca

Standort

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