Kurzbeschreibung
Pacific Biosciences of California, Inc. (PacBio) ist der einzige Anbieter von hochpräzisen Long-Read-Sequenzierungen mit der firmeneigenen Single Molecule Real-Time (SMRT®) Sequenzierungstechnologie, die gleichzeitig die Nukleotidsequenz und den Methylierungsstatus einzelner langer genomischer DNA-Moleküle bestimmt. PacBio ist auch der einzige Hersteller des Revio-Systems, das SMRT-Sequenzierung in großem Maßstab anwendet, um bis zu 100 Millionen einzelner Moleküle auf einmal zu sequenzieren. Das Revio-System verwendet nanofabrizierte Mikrochips namens Revio SMRT® Cells und andere maßgeschneiderte Sequenzierungsreagenzien, die ausschließlich von PacBio bereitgestellt werden. Das System stützt sich auf Patente, die PacBio gehören oder durch PacBio lizenziert sind und die das Gerät, die Sequenzierchips und die Sequenzierreagenzien abdecken. Die wesentlichen Patente umfassen Einzelmolekül-Sequenzierungsmethoden, Polymerase-Enzyme, Nukleotid-Analoga, Farbstoffe, Membranporen in Nanomaßstab (zero-mode waveguide: ZMW), Reaktionszusammensetzungen, Probenvorbereitung („Library“) und integrierte Sequenzierungschips.
Ansprechperson
Katharina Herzog, PhD
Research Services
Derzeit ist keine Research Service durch die Infrastruktur möglich. Bei Interesse melden sich Interessierte bitte bei: Katharina Herzog, PhD (katharina.herzog@i-med.ac.at)
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Bisheriges Know-how betrifft neben allen Arten der PCR (Multiplex-, real-time, allelspezifisch, Triplett-primed …) und der Sanger-Sequenzierung, seit einigen Jahren auch die Exom-Sequenzierung (sog. short-read Sequenzierung) mit massiv-paralleler Sequenziertechnik an Geräten von Illumina (MiSeq, NextSeq500, NextSeq2000). Diese Expertise wird nun kombiniert mit der long-read Sequenzierung von PacBio, die die Sequenzierung von bis zu mehreren 10.000 Nukleotiden an einem Stück und die basengenaue Analyse von komplexen Genomregionen, Pseudogenen oder Repeat-Abschnitten erlaubt.