Kurzbeschreibung
Das Illumina MiSeq i100 Plus ist ein kompaktes Benchtop-Next-Generation-Sequencing-System (NGS) für schnelle und flexible Sequenzierungsanwendungen mit mittlerem Durchsatz. Das System ermöglicht eine effiziente Durchführung von gezielten Sequenzierungsprojekten und kleineren Genom- oder Metagenom-Analysen direkt im Labor.
Die Plattform basiert auf Illuminas Sequencing-by-Synthesis-Technologie (SBS) und nutzt moderne XLEAP-SBS-Chemie, die eine hohe Datenqualität sowie verkürzte Laufzeiten ermöglicht. Je nach Flow-Cell-Konfiguration können 1,5–30 Gb Sequenzdaten pro Lauf erzeugt werden, mit bis zu 200 Millionen paired-end Reads und maximalen Readlängen bis zu 2 × 300–500 bp.
Ein wesentliches Merkmal des MiSeq i100 Plus ist die hohe Flexibilität durch mehrere Flow-Cell-Formate (5M, 25M, 50M und 100M Reads), wodurch unterschiedliche Projektgrößen effizient bearbeitet werden können. Sequenzierungsläufe dauern typischerweise 4 bis 24 Stunden, sodass Ergebnisse oft noch am selben Tag verfügbar sind.
Die Plattform ist besonders geeignet für Anwendungen wie: Targeted Sequencing Panels, Amplicon-Sequenzierung (z. B. 16S/ITS-Profiling), Sequenzierung kleiner Genome (Bakterien, Viren), Plasmid- und CRISPR-Validierung, Metagenomische Analysen. Durch integrierte Analysefunktionen, vereinfachte Workflow-Schritte und Reagenzien, die bei Raumtemperatur gelagert werden können, ermöglicht das System eine besonders benutzerfreundliche und effiziente Durchführung von Sequenzierungsprojekten. Das MiSeq i100 Plus erweitert damit die Sequenzierungskapazitäten der Einrichtung insbesondere für schnelle, flexible und kosteneffiziente Projekte mit moderatem Durchsatz.
Ansprechperson
Ellen Heitzer
Research Services
Zugang über Diagnostik & Forschungsinstitut für Humangenetik
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Die Sequenzierungsplattform MiSeq i100 Plus wird an unserem humangenetischen Institut mit umfangreicher Expertise im Bereich Next-Generation Sequencing (NGS) betrieben. Die Sequenzierungsinfrastruktur umfasst mehrere moderne NGS-Plattformen, darunter MiSeq i100 Plus, NextSeq 550, NovaSeq 6000 und NovaSeq X Plus, wodurch ein breites Spektrum an Anwendungen von gezielten Sequenzierungen bis hin zu großskaligen genomischen Studien ermöglicht wird.
Die langjährige Expertise im Bereich NGS sowohl in der klinischen Diagnostik als auch in der translationalen Forschung wird durch zahlreiche wissenschaftliche Publikationen des D&F Zentrums für Molekulare BioMedizin sowie durch die Akkreditierung von NGS-Verfahren am Institut für Humangenetik (ISO 15189) unterstrichen. Die vorhandene Expertise umfasst den gesamten Workflow von der Probenaufarbeitung über die Sequenzierung bis hin zur bioinformatischen Analyse und Interpretation der Daten und bildet damit eine wichtige Grundlage für wissenschaftliche Kooperationen und innovative Forschungsprojekte.
D&F Institut für Pathologie, Med Uni Graz
D&F Institut für Hygiene, Mikrobiologie und Umweltmedizin, Med Uni Graz
Zentrum für medizinische Forschung, Med Uni Graz
Institut für biomedizinische Informatik, TU Graz
Medizinische Genetik, Innsbruck