Andromeda X Package

Veterinärmedizinische Universität Wien

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Open for Collaboration

Kurzbeschreibung

Das NanoTemper Andromeda X ist ein hochmodernes biophysikalisches Gerät, das entwickelt wurde, um die Stabilität von RNAs zu messen und die Expression sowie die Qualität rekombinanter Proteine in der frühen Phase der Wirkstoffforschung zu optimieren. Es verwendet Nano Differential Scanning Fluorimetry (nanoDSF), eine Technik zur Überwachung der Proteinstabilität durch Messung der Veränderung der Eigenfluoreszenz in Abhängigkeit von der Temperatur – es wurde vor Kurzem gezeigt, dass das gleiche Prinzip auch zur positions-spezifischen Stabilitätsmessung von RNAs verwendet werden kann. Bei Proteinen beruht das Prinzip auf der Tatsache, dass sich die Umgebung der Tryptophan- und Tyrosinreste in einem Protein bei thermischer Denaturierung verändert, was zu einer Verschiebung des Emissionsspektrums führt. Bei RNAs müssen spezifische Fluoreszenzmarker an bestimmten Stellen eingebaut werden. Während des Erhitzens entfaltet sich das Protein und die Freilegung der hydrophoben Bereiche führt zu einer Veränderung der Fluoreszenzintensität, die in Echtzeit erfasst wird. Bei RNAs kommt es bei der Entfaltung zu einer Veränderung der Umgebung des eingebauten Fluorophors. Durch die Analyse der Temperatur, bei der diese Fluoreszenzänderungen auftreten, liefert nanoDSF Informationen über die Schmelztemperatur (Tm) des Proteins/RNA, die seine Stabilität widerspiegelt.

Ansprechperson

Sebastian Glatt

Research Services

RNA-Stabilität, RNA Faltung, Bindung von chemischen Molekülen an RNA

Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur

Es verwendet Nano Differential Scanning Fluorimetry (nanoDSF), eine Technik zur Überwachung der Proteinstabilität durch Messung der Veränderung der Eigenfluoreszenz in Abhängigkeit von der Temperatur – es wurde vor Kurzem gezeigt, dass das gleiche Prinzip auch zur positions-spezifischen Stabilitätsmessung von RNAs verwendet werden kann.