Kurzbeschreibung
Dieses Gerät umfasst eine Next Generation Sequenzierplattform zur Charakterisierung von DNA, RNA und Proteinprofilen. DNA, RNA und Proteine können aus Geweben und Flüssigkeiten isoliert werden und nach Vorbehandlung und Qualitätskontrolle sequenziert werden. Die vorliegende Sequenziertechnologie basiert auf einer zyklischen Amplifikation des Original-DNA-Stranges, wodurch eine besonders niedrige Rate an Lesefehler und dadurch eine hohe Kosteneffizienz erreicht wird. Das Gerät verfügt auch über die Möglichkeit ganze Zellen umfassend zu charakterisieren und sequenzieren (in-situ targeted RNA-seq und Proteinprofiling).
Ansprechperson
Adelheid Woehrer
Research Services
Es werden Next-Generation-Sequenzierungen (z.B. DNA/RNA) durchgeführt.
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Das Gerät wird insbesondere für Forschungsfragen in den Bereichen Neuroonkologie, Neuroimmunologie und Neurodegeneration eingesetzt. Die Anwendung erfolgt durch ein multidisziplinäres Team aus Fachärzt:innen für Neuropathologie und Pathologie, Biolog:innen und Bioinformatiker:innen mit langjähriger Expertise in der Erforschung von Krankheiten wie dem Glioblastom oder der Alzheimer Krankheit. Beispiele umfassen das Drug screening von Tumorzellen, eine Multi-ome Charakterisierung von Entzündungsantworten in Gewebe und Körperflüssigkeiten bei Patienten mit neurologischen Erkrankungen und eine proteomische Charakterisierung auf Einzelzellebene zur individualisierten Biomarkerentwicklung bei Patienten mit Demenz.