Kurzbeschreibung
Die MACSima Imaging Plattform ist ein vollautomatisiertes Fluoreszenzmikroskop, das es ermöglicht, 200+ Proteine auf einer einzigen Probe (FFPE, fresh frozen oder Zellkultur) aufzunehmen, und schafft so Zugang zu Spatial Proteomics. Das Gerät führt zyklische Färbung, Aufnahme und Entfärbung vollautomatisiert durch. Multiomics durch Aufnahme von bis zu 27 RNAs bzw. Kombination mit anderen Technologien möglich.
Ansprechperson
Anna Wedl
Research Services
Vollautomatisierte Bildaufnahme und Farbezyklen, Zugang zu Analysesoftware, Hands-on-Support bei der Experimentplanung, Verbrauchsmaterialien (bis auf experimentspezifische Materialien)
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Das Mikroskop eignet sich zur Aufnahme von bis zu 200-fachen Immunofluoreszenzfärbungen an derselben Probe. Ein Färbezyklus besteht aus Färbung, Bildaufnahme und Signalauslöschung. Pro Zyklus stehen drei Farbkanäle zur Verfügung, bis zu ca. 65 Zyklen können pro Run durchgeführt werden. Die Signalauslöschung geschieht enzymatisch oder mittels Bleichung. Die Betreuer haben Expertise im Paneldesign, Experimentoptimierung, Troubleshooting, Experimentdurchführung, Datenanalyse mit der zugehörigen MACSiQ View Software. In der Datenanalyse können differentiell exprimierende Zellen durch FACS-ähnliches Gating identifiziert, quantifiziert und lokalisiert werden.
Mögliche Fragestellungen: Wie unterscheidet sich die Lokalisation und der prozentuelle Anteil von verschiedenen Zellpopulationen im gesunden vs. kranken Gewebe? Sind verschiedene Tumorzellsubtypen in unterschiedlichen Nischen konzentriert, und welche Immunzelltypen befinden sich in deren Nähe?