Kurzbeschreibung
Beim Array-Scanner "iScan" System Illumina handelt es sich um einen Array Scanner für die schnelle, präzise und sensitive Bildverarbeitung von Infinium BeadChip Arrays. Er ermöglicht das Scannen von Hunderten von Proben pro Tag und unterstützt verschiedene Illumina Assays wie DNA-Methylierung, Genotypisierung und Copy Number Variation (CNV).
Ausstattung:
- iScan System
- Illumina Autoloader 2.x
- Tecan Robot
Ansprechperson
Elisa Redl
Research Services
Genom-weite high-throughput DNA-Methylierungsanalyse von bis zu 850.000 CpGs gleichzeitig mittels Infinium MethylationEPIC BeadChip Arrays. Der Illumina Autoloader 2.x und ein Tecan-Roboter ermöglichen die automatisierte und rasche Analyse von mehreren Proben gleichzeitig ohne extensive hands-on Zeit.
Die Forschungsinfrastruktur ist "Open for Collaboration". Kommerzielle Kooperationen sind nicht möglich.
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Das iScan System ermöglicht high-throughput Bildverarbeitung von Infinium MethylationEPIC BeadChip Arrays zur genom-weiten Analyse von DNA-Methylierung. Infinium MethylationEPIC BeadChips ermöglichen die gleichzeitige Analyse von bis zu 850.000 CpGs pro Sample in bis zu 192 Proben pro Analyse. Koppelung mit dem Illumina Autoloader 2.x und einem Tecan Roboter ermöglicht darüber hinaus die automatisierte Be- und Entladung der BeadChips und des iScans und vereinfacht somit die Anwendung und ermöglicht high-throughput DNA-Methylierungsanalysen.
Nutzungsbedingungen werden im Rahmen einer wissenschaftlichen Kooperation definiert. Keine kommerzielle Nutzung möglich. Bei Interesse an einer Kooperation oder Zusammenarbeit bitten wir Sie um Kontaktaufnahme.
- 2020
- Nené NR, Barrett J, Jones A, Evans I, Reisel D, Timms JF, Paprotka T, Leimbach A, Franchi D, Colombo N, Bjørge L, Zikan M,
Cibula D, Widschwendter M.
- Clin Epigenetics. 2020 Nov 23;12(1):180.
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7686703/
- doi: 10.1186/s13148-020-00966-7.