Kurzbeschreibung
Der Whole‑Slide Image Scanner NanoZoomer S60 der Firma Hamamatsu ermöglicht das Digitalisieren mikroskopischer Schnitte. Die entstehenden digitalen Bilder (Dateiformat: .ndpi) können mit geeigneter Viewing‑Software betrachtet und für computergestützte Analysen verwendet werden.
Der Scanner ermöglicht Hellfeldscans mit 20‑facher (Bildauflösung: 0,46 µm/Pixel) und 40‑facher Vergrößerung (Bildauflösung: 0,23 µm/Pixel). Er kann mit bis zu 60 Objektträgern der Größe 25–26 × 75–76 mm beladen werden. Die Scanzeit pro Gewebefläche von 15 × 15 mm beträgt laut Herstellerangaben 60 Sekunden bei 20‑facher und 75 Sekunden bei 40‑facher Vergrößerung. Das Scannen in mehreren z‑Ebenen (Z‑Stacks) ist möglich.
Ansprechperson
Christof Bertram
Research Services
Forschungsservice nach individueller Anfrage
Methoden & Expertise zur Forschungsinfrastruktur
Der Scanner ist in die Pathologie integriert, wo er zur Digitalisierung mikroskopischer Proben (insbesondere histologischer und immunhistochemischer Präparate) für verschiedene Forschungsprojekte eingesetzt wird. Die digitalen Bilder werden von verschiedenen Arbeitsgruppen genutzt, um quantitative Daten aus den mikroskopischen Bildern zu generieren. Eine Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der Entwicklung und Validierung KI‑gestützter Bildanalysealgorithmen.
Zuordnung zur Forschungsinfrastruktur
- Medizinische Unversität Wien, Klinisches Institut für Pathologie, Forschungsgruppe Digitale Pathologie